香港有不少似乎適合燕鷗繁殖的海島，但是牠們卻非常挑剔，只選擇其中幾個細小、有高聳峭壁的石質小島。

細小的海島通常沒有老鼠或蛇等捕食者，高聳的峭壁可以阻隔例如遊人的干擾，把危險減到最少。可是，本地繁殖的燕鷗仍要面臨不少威脅，其中最嚴峻的是惡劣天氣。颱風會為繁殖地帶來巨大的災難，鳥蛋會被強風吹走或被大雨沖去，連日大雨更會弄濕鳥蛋和幼鳥，令牠們因低溫而死亡。一個猛烈的颱風會殺死30%的鳥蛋和幼鳥，如果颱風在繁殖期的初期吹襲，燕鷗多數會在劫後嘗試再次生育。燕鷗面對的另一個重要威脅是其他動物，尤其是猛禽。在繁殖地有時可以見到遊隼捕吃成鳥和幼鳥，又有白腹山鵰捕捉燕鷗，但是如果繁殖群落數量夠多，燕鷗可以忍受幾隻猛禽經常性的侵襲。總括來說，目前香港似乎仍然是燕鷗的理想繁殖地。

除了天氣外，人類才是燕鷗的頭號敵人。人們會取去牠們的蛋和幼鳥，或是在牠們的哺蛋地附近活動，騷擾牠們繁殖。香港和鄰近深圳地區(尤其是貨櫃碼頭)的急速發展，已經對牠們構成潛在的長期威脅，偶然在一些燕鷗身上出現的油污就是證據。雖然如此，如果有足夠的有心人關注和支持，我們應該可以將這個人為的不利形勢扭轉過來。

研究與保育

香港觀鳥會自1998年開始便展開有關香港繁殖燕鷗的調查，當時調查範圍集中在香港東北水域，為當時已知最大燕鷗繁殖群落的所在地。2001年開始，我們不定期地參與漁護署的繁殖燕鷗調查，其後更把調查範圍擴展至南部及東南部水域。近年調查之餘亦同時進行教育工作，於調查當日遇見登上繁殖島嶼的遊人，工作人員會作出勸喻及教育，藉此加強遊人對繁殖燕鷗的保育意識。